I followed this official blog post "Buffer protocol support" and came up with a short example of simple video player in panda3d using numpy 2d array as texture. The trick was to use setRamImage on Texture object. To do that, we have to setup the memory layout using setup2dTexture method.

Texture format and Texture componentType need to be set correctly. By try and error, I figured that the combination of T_unsigned_byte and F_luminance works for 8 bit gray scale image.

def interp_nan(x):
    '''
    Replace nan by interporation
    http://stackoverflow.com/questions/6518811/interpolate-nan-values-in-a-numpy-array
    '''
    ok = -np.isnan(x)
    xp = ok.nonzero()[0]
    fp = x[ok]
    _x = np.isnan(x).nonzero()[0]
    x[-ok] = np.interp(_x, xp, fp)
    
    return x

Site-packagesに入れていつでもインポートできるようにしておくと便利なスニペット。もともとはStackoverflowで見つけたものほぼそのまま。ravelが何で入れてあるのかコメントで突っ込まれていて、確かになくとも動くのでとっておいた。

いつもと違うPCなんかでコーディングするときようの覚書。Pygmentsにもあげておいた。

使用例

>>> toy = np.array([np.nan, 1, np.nan, 3, np.nan, 9, np.nan, 2, np.nan])
>>> interp_nan(toy)
0: array([ 1. ,  1. ,  2. ,  3. ,  6. ,  9. ,  5.5,  2. ,  2. ])

Blenderのバージョンとの相性

Blenderのデベロッパーは頻繁にGUIや内部の仕様を変えるらしく、Chickenがメンテできなくなったのも多分そのため。なので、YABEEを使うときは組み合わせるBlenderのバージョンに注意する必要がある。 いまGithubにあるYABEE-master.zipはPanda3dのフォーラムによるとリビジョン１４（r14）に当たるらしいが、Readmeなどは面倒なので更新していなためr13.1と区別が付かないので注意。

一応Readmeには2.7もサポートとあり最新版の2.74でも一応使えたが、フォーラムを見て回ると、r13.1まではBlenderの2.68aと組み合わせて使う人が多いようなのでBlender公式サイトの過去のバージョンのページから2.68aをダウンロードして使うのが安心かもしれない。

YABEEのインストール

GithubのReadmeがまったく内容がないので、最初戸惑うがYABEE-master.zipに同梱されているYABEE_HowTo.pdfというちゃんとしたマニュアルがありインストール方法もある。マニュアルは多少古い。

お勧めはCtrl+Alt+UでBlenderのユーザープレファレンスをだして、Addonsタブを選び、Install from FileからYABEE-master.zipを指定し、eggにエクスポートするオプションにチェックする。ここでSave User settingsを押しておかないと次回起動にまたチェックすることになる。その場合、Addonsのタブの左CategoriesからImport-Exportを選ぶと探しやすい。

YABEE使い方

Blenderは手軽に美しいmaterialやテクスチャを生成できるCycles Renderが売りだと思うが、これで生成したゴージャスなmaterialやテクスチャはエクスポートできないようなのでデフォルトのBlender Renderですべて行う。悲しい。うまくBakeする方法があるのではないかと思うがBlender歴2週間なのでまだ良くわからない。

YABEEは残念ながらChickenに比べてエクスポートの機能は制限されるようだが、一応meshにイメージテクスチャをUVマッピングした状態でエクスポートできる。materialのエクスポートはかなり制限されるのでPandaの方でやり直しになる。ただし、materialが全くないとイメージテクスチャも無効になるのでデフォルトの materialくらいはつけておく。アニメーションもエクスポートできるようだけど今のところ必要ないので試していない。

エクスポートするときは対象のmeshを選択した状態でFileからeggのエクスポートを選択する。YABEEではライトはエクスポートされないのでPanda3dの方で適切に光を当てないと見え方が変わるので注意。私は、エクスポートする直前にSave asでBlenderファイルをコピーして、欲しい物以外すべて削除した状態でエクスポートを実行している。そうしないと要らないものもエクスポートされているような気がする。。。

{
    "cmd": ["C:/Panda3D-1.9.0/python/ppython.exe", "$file"],
    "file_regex": "^[ ]*File \"(...*?)\", line ([0-9]*)",
    "selector": "source.python",
    "working_dir": "C:/Panda3D-1.9.0/bin"
}

bool値で満たされた行列の初期化

nanで満たされた行列の初期化

np.emptyはいつ使うのか

使い方

wx.auiとwx.lib.agw.auiの違い

wx.lib.agw.aui is a re-implementation of wx.aui using only Python code.

• シンプルなJabRefのインターフェイスっぽいもの。
• タブグループマネージャー機能。Bib managerから、いくつかの関連する文献をまとめて複数のタブとしてPDF Viewerで開いたり、グループを切り替えたりしたい。
• ポータブルなアプリでDropboxに入れて置けると一番良い。
• JabRefみたいに選択した論文をいろいろな雑誌のReferenceのフォーマットでワードに貼ればいいだけなリッチテキスト形式として出力したい。Citeulikeでは有料オプション。
• bibtexのインポートをサポート（当たり前）
• フリー

biblio-py

BibtexManager-Python

BibReview

BibtexParser

import bibtexparser
with open('bibtex.bib') as bibtex_file:
    bib_database = bibtexparser.load(bibtex_file)

bibtex_str = bibtexparser.dumps(bib_database)

newBibDb = bibtexparser.bibdatabase.BibDatabase()

newBibDb.entries = sublist

ランチャー部分の実装

import subprocess
from time import sleep

def PDFopen(files, 
            libraryPath = 'C:\\Dropbox\\PathToYour\\PDFs'
            execPath = r'C:\Path2\PDF-XChangeViewerPortable.exe'
            ):
    
    if type(files) is not list:
        raise ValueError('The first arg should be a list containing more than one file path')
        return

    P = subprocess.Popen([execPath, files[0]])
    sleep(2) # wait until the instance is ready for more files

    for pdf in files[1:]:
        P = subprocess.Popen([execPath, pdf])


if __name__ == '__main__':

    files = [
    'Einstein1997.pdf',
    'Heisenberg2005.pdf',
    'Kandel2009.pdf',
    'Galileo1662.pdf',
    ]
    PDFopen(files, libraryPath)